گروه‌بندی فیلوژنتیکی برخی جدایههای نوکلئوپلی‌هیدروویروس کرم غنچه‌ی توتون (HaNPV) شمال ایران با استفاده از نشانگر RAPD
نویسندگان
چکیده مقاله:
به‌منظور غربال و بررسی تنوع ژنتیکی جدایههای نوکلئوپلیهدروویروس جمعآوری شده از کرم غنچه توتون از برخی مزارع توتون استان‌های مازندران و گلستان، از بین 10 آغازگر RAPD ده جفت بازی ساخت شرکت Operon به‌طور تصادفی ، دو جفت آغازگر OPM-03 و OPM-16 که بیشترین چندشکلی را در بین جدایه‌ها نشان دادند، انتخاب شدند. تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی با استفاده از نرم افزار PyElph و به‌روش UPGMA انجام و درخت فیلوژنی و جدول فواصل ژنتیکی رسم شد. تجزیه‌ی خوشه‌ای داده‌های مولکولی توانست جدایه‌ها را در فاصله‌ی ژنتیکی 20 به‌پنج گروه مجزا تقسیم بندی کند و می‌تواند در غربال جدایههای نوکلئوپلی هدروویروس به‌عنوان عامل کنترل بیولوژیک در کنترل کرم غنچه‌ی توتون، کرم قوزه‌ی پنبه، کرم میوه‌خوار گوجه‌فرنگی نقش ایفا نماید.
منابع مشابه
بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت های مختلف گل محمدی شمال غرب ایران با استفاده از نشانگر RAPD
در این پژوهش نشانگر مولکولیRAPD برای تعیین تنوع ژنتیکی 12 جمعیت گل محمدی شمال غرب ایران مورد استفاده قرار گرفت. با استفاده از 22 آغازگر، تعداد 262 باند قابل تشخیص ایجاد شد که 67% آنها ( 180 باند) در بین جمعیتهای مختلف چند شکلی نشان دادند. تعداد متوسط باندها به ازای هر آغازگر 9/11 بود. شاخص تشابه Dice برای تعیین همسانیهای ژنتیکی بین جمعیتها مورد استفاده قرار گرفته و با استفاده از الگوریتم UPGMA ...
متن کاملارزیابی تنوع ژنتیکی برخی از ژنوتیپهای سیب ایران با استفاده از نشانگر RAPD
جمعآوری و ارزیابی ژرمپلاسمها در برنامههای اصلاحی درختان میوه دارای نقش اساسی است. نشانگرهای مولکولی متفاوتی برای این نوع ارزیابیها بهکار برده شدهاند که مارکر RAPD جزء مارکرهای پرکاربرد در مورد شناسایی ژنوتیپها و ارقام گوناگون سیب میباشد. در این پژوهش تنوع ژنتیکی 23 ژنوتیپ بومی ایران (از سه منطقه آذربایجان، البرز مرکزی و زاگرس مرکزی) و رقم تجاری گرانیاسمیت به عنوان شاهد توسط 11 آ...
متن کاملبررسی تنوع ژنتیکی بین و درون جمعیت¬های شمشاد در جنگل¬های شمال ایران با استفاده از نشانگر مولکولی RAPD
به‌منظور بررسی تنوع ژنتیکی بین و درون‌جمعیتی، سه جمعیت طبیعی شمشاد (Buxus hyrcana Pojark.) در شمال کشور (چشمه‌بلبل بندرگز، سیسنگان نوشهر و قرن‌آباد گرگان) با استفاده از نشانگرهای مولکولی RAPD بررسی شدند. نتایج نشان داد که تنوع ژنتیکی به‌نسبت مطلوبی (حدود 29 درصد) در جمعیتهای مورد بررسی وجود دارد، به‌گونه‌ای که از 9/22 درصد در جمعیت قرن‌آباد گرگان تا 3/28 درصد در ...
متن کاملبررسی تنوع ژنتیکی جمعیت های مختلف گل محمدی شمال غرب ایران با استفاده از نشانگر rapd
در این پژوهش نشانگر مولکولیrapd برای تعیین تنوع ژنتیکی 12 جمعیت گل محمدی شمال غرب ایران مورد استفاده قرار گرفت. با استفاده از 22 آغازگر، تعداد 262 باند قابل تشخیص ایجاد شد که 67% آنها ( 180 باند) در بین جمعیتهای مختلف چند شکلی نشان دادند. تعداد متوسط باندها به ازای هر آغازگر 9/11 بود. شاخص تشابه dice برای تعیین همسانیهای ژنتیکی بین جمعیتها مورد استفاده قرار گرفته و با استفاده از الگوریتم upgma ...
متن کاملبررسی تنوع ژنتیکی برخی از پایه های پاکوتاه کننده سیب با استفاده از نشانگر مولکولی RAPD
در این تحقیق تنوع ژنتیکی 19 پایه اصلاح شده سیب در انگلستان و روسیه که از مناطق مختلف ایران جمع آوری شده همراه با 12 ژنوتیپ و پنج نمونه حاصل از کشت بافت به کمک نشانگرDNA (RAPD) مورد بررسی قرار گرفت. تعداد 100 آغازگر تصادفی در انجام واکنش PCR روی نمونه ها ارزیابی شد که 10 آغازگر تکثیر DNA الگو را به خوبی انجام داده و بین نمونه ها چند شکلی قابل ملاحظه ای نشان دادند. این 10 آغاز گر در مجموع 160 بان...
متن کاملارزیابی تنوع ژنتیکی برخی از ژنوتیپهای سیب ایران با استفاده از نشانگر rapd
جمعآوری و ارزیابی ژرمپلاسمها در برنامههای اصلاحی درختان میوه دارای نقش اساسی است. نشانگرهای مولکولی متفاوتی برای این نوع ارزیابیها بهکار برده شدهاند که مارکر rapd جزء مارکرهای پرکاربرد در مورد شناسایی ژنوتیپها و ارقام گوناگون سیب میباشد. در این پژوهش تنوع ژنتیکی 23 ژنوتیپ بومی ایران (از سه منطقه آذربایجان، البرز مرکزی و زاگرس مرکزی) و رقم تجاری گرانیاسمیت به عنوان شاهد توسط 11 آغازگر ...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 3 شماره 2
صفحات 123- 129
تاریخ انتشار 2016-02-20
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023